Fyra
första veckorna på klinisk kemi har nu passerat och då var det
dags att börja på vår nästa placering här i Thailand vilket var
mikrobiologi.
Dem
första tre dagarna visade dem runt i hela labbet och vi fick se lite
av allt dem gör där. Dem hade även förberett plattor som vi
skulle läsa av och sen skriva ner på ett papper vilka bakterier det
var och beskriva kolonierna. Då fick vi göra katalas och oxidas
test, och även gram färga om vi kände att det behövdes. Eftersom
det var första gången för oss kunde vi för det mesta endast
beskriva kolonierna och fick därefter hjälp av dem för att komma
fram till vilka bakterier det var. Då förklarade dem även vad som
är typiskt för varje bakterie och även lite kring dem biokemiska
analyserna dem kör senare för att identifiera varje bakterie.
Dem väljer rör för biokemiska analyserna baserat på vilken group bakterien hör till, vilket dem tar reda på genom att läsa av plattorna. När dem har läst av alla plattorna som inkuberades dagen innan, tar dem fram rör innehållande olika biokemiska ämnen för alla bakterier. Rören förbereds av sjukhuspersonalen. Dem förbereder även MacConkey agar plattorna som används där, men vi såg aldrig hur det går till, vi gick inte ens in i det rummet.
Dem väljer rör för biokemiska analyserna baserat på vilken group bakterien hör till, vilket dem tar reda på genom att läsa av plattorna. När dem har läst av alla plattorna som inkuberades dagen innan, tar dem fram rör innehållande olika biokemiska ämnen för alla bakterier. Rören förbereds av sjukhuspersonalen. Dem förbereder även MacConkey agar plattorna som används där, men vi såg aldrig hur det går till, vi gick inte ens in i det rummet.
Rören
kan tex innehålla bile-eskulin, mallonate, maltos och andra
sockerarter, urease, citrat osv. Vilka rör som används beror på
vilken grupp bakterien tillhör och även på om bakterien är gram
positiv eller negativ. För staphylokocker tex används 4 rör
innehållande coagulase, mannitol, trehalose och urease. Just för
staphylokocker görs även screening test för staph. Aureus med
slide latex agglutination innan, och om den är negativt tillsätts
ett till rör innehållande ornithine decarboxylase till biokemiska
analysen. Är det däremot enterokocker används 4 rör innehållande
bile-eskulin, 6,4% NaCl, arabinose och sorbitol. Är det gram
negativa bakterier används nästan alltid rör innehållande TSI,
LDC/LDA, citrate och urease. Därefter tillsätts fler analyser om
det behövs för bakterier som är svårare att identifiera. För
alla bakterier som antimicrobial susceptibility test ska göras
används även ett rör med broth där 3-4 kolonier tillsätts.
Därefter kan detta röret spädas med NSS om för många bakterier
finns och lösningen blir grumlig. De följer McFarland standards för
detta, så över 0,5 mcfarland ger grumlighet.
Dem
markerar de första 2 rören i biokemiska analysen för varje
bakterie och sedan tar dem 1 koloni från plattan med det dem
använder istället för ögglor som dem vi har i sverige och sprider
den i alla rören som ska användas. När det är klart inkuberas
alla rör över natt.
Efter detta görs antimicrobial susceptibility testing för nästan alla
bakterier förutom dem som endast skulle identifieras. För dem gram positiva bakterierna görs detta i samband med att
plattorna läses av, För dem gram negativa bakterierna görs det
senare. Bakterierna är uppdelade i samma grupper som för biokemiska
analyserna alltså enterobacteriaceae, Gnf(Gram negative, non
fermentative bakterie) och vibrionaceae för dem gram negativa
bakterierna och Staphylococcer, α-,β-
och γ-streptococci
och enterococci för dem gram positiva. Så dem börjar med att
sprida bakteriekolonierna på plattorna med en bomulls-pinne som
doppas i röret innehållande broth och kolonierna och sedan
tillsätts alla antibiotika lappar på varje platta.
Alla
patient prover som kommer till mikrobiologen sorteras i 10 grupper
beroende på vad det är för provmaterial mm. Så grupp 1 är urin,
grupp 2 pus, grupp 3 sputum, grupp 4
kroppsvätskor/cerebrospinalvätska, grupp 5 stool, grupp 6
hemo-culture, grupp 7 tuberkulos, grupp 8 svamp och grupp 9 anaerob
och grupp 0 som är mikroskopering. Proverna märks och sedan odlas
upp på plattor och för vissa görs även gram- och/eller AFB
färgning om läkaren har beställt det.
Torsdag
och fredag första veckan fick vi även jobba lite med tuberkulos,
efter att ha frågat om vi fick se lite hur dem gör. Labbet dem har
för TB är separat från resten av mikrobiologen men det är
fortfarande endast riskklass 2. Vi fick ta på oss ordentligt med
skydds kläder och fick endast utföra varsitt prov efter att ha
tittat på när personalen utförde dem första proverna. Dem är riktigt rädda om oss här!
Vi fick vänta länge mellan varje steg och då fick vi klä av oss och gå ut ur rummet tills det var dags att påbörja nästa steg. Det var ändå kul att se hur dem jobbar osv.
Vi fick vänta länge mellan varje steg och då fick vi klä av oss och gå ut ur rummet tills det var dags att påbörja nästa steg. Det var ändå kul att se hur dem jobbar osv.
Efter
att ha följt personalens arbete dem första dagarna var vi redo att
själva arbeta med patient proverna nästa vecka.
Vi pratade med chefen för mikrobiologi avdelningen och hon tyckte att vi skulle göra alla steg som de gör på labbet varje dag, alltså läsa av plattor, förbereda biokemiska analyserna för bakterierna, läsa av biokemiska analys-resultat, märka in och odla upp 7 patient prover på plattor samt gram färga och titta i mikroskop om det behövs för dem proverna och, om vi hinner, göra susceptibility testing för dem gram negativa bakterierna. Det funkade superbra!
Så dem följande veckorna fick vi jobba självständigt med våra egna prover. Självklart kontrollerade dem att vi gjorde rätt mellan varje steg och rättade oss om vi hade fel, men annars fick vi göra allt själva. Dock var det lite segt med patient prover ibland, men det gav oss tid att fråga om annat vi undrade över eller hjälpa sjukhuspersonalen med det dem gjorde. Jag tycker tiden på mikrobiologen passerade väldigt snabbt och att det var jätte kul! Men det är nog mitt favorit ämne så det är kanske lite på grund av det också.. Men generellt mycket bra planering tack vare mikrobiologi chefen!
Vi pratade med chefen för mikrobiologi avdelningen och hon tyckte att vi skulle göra alla steg som de gör på labbet varje dag, alltså läsa av plattor, förbereda biokemiska analyserna för bakterierna, läsa av biokemiska analys-resultat, märka in och odla upp 7 patient prover på plattor samt gram färga och titta i mikroskop om det behövs för dem proverna och, om vi hinner, göra susceptibility testing för dem gram negativa bakterierna. Det funkade superbra!
Så dem följande veckorna fick vi jobba självständigt med våra egna prover. Självklart kontrollerade dem att vi gjorde rätt mellan varje steg och rättade oss om vi hade fel, men annars fick vi göra allt själva. Dock var det lite segt med patient prover ibland, men det gav oss tid att fråga om annat vi undrade över eller hjälpa sjukhuspersonalen med det dem gjorde. Jag tycker tiden på mikrobiologen passerade väldigt snabbt och att det var jätte kul! Men det är nog mitt favorit ämne så det är kanske lite på grund av det också.. Men generellt mycket bra planering tack vare mikrobiologi chefen!
Det har gått en månad nu sen wifi i mitt rum dog, så det har varit lite svårt att plugga osv men vi frågade sjukhuspersonalen och dem sa att vi kan sitta kvar där om det behövs.
Så det kommer ett till inlägg snart, nu när vi har hittat en lösning till internet problemet.
Så det kommer ett till inlägg snart, nu när vi har hittat en lösning till internet problemet.
Bästa hälsningar,
Veronika :)
Veronika :)